Z dniem 1 kwietnia 2008 dyrektorem Wydziału Instytucji Pośredniczącej w Certyfikacji został Krzysztof Smoczyk, który pracował wcześniej na stanowisku dyrektora Wydziału Zarządzania Funduszami EuropejskimiMariola Tatkowska, dotychczas kierownik Oddziału Weryfikacji i Potwierdzania Płatności w WZFE, objęła stanowisko dyrektora Wydziału Zarządzenia Funduszami Europejskimi.